El rey Carlos III (1759-1788) mandó construir un camposanto en los jardines de palacio de El Buen Retiro, para que en él reposaran los restos de los trabajadores del palacio, como premio a su dedicación.

Hay datos de que en 1787 se construye una capilla en los jardines, para atender a las necesidades del camposanto, que estaba dedicada a San Fernando.

También hay noticias confirmadas de que en este camposanto se enterraron algunos de los muertos de la sublevación contra los franceses en los días 2 y 3 de mayo de 1808 que dieron origen a la Guerra de la Independencia.

Estaba situado en una zona no determinada, situada entre la plaza del Ángel Caído, el Palacio de Cristal y la calle Alfonso XII.

A final del siglo XIX se remodeló toda la zona con motivo de la construcción el Paseo de Fernán Núñez (Paseo de Coches), desapareciendo el cementerio.  No se sabe qué hicieron con los restos.