Situado entre la calle Vitruvio y el Museo de Ciencias Naturales, está dividido en tres zonas principales: la montaña, situada en lo más alto del jardín, el monte, donde se representan las especies de los yesos de Madrid y la zona de transición situada entre los dos ecosistemas.

Cinco módulos recrean los ecosistemas que integran el Bosque Mediterráneo: el Jardín de las Rocas, con rocas representativas de cada región; los Yesos con plantas del sureste; las Calizas en representación de la zona este de la provincia; la Zona de Transición con encinares y fresnedas; y la Montaña con pinos albares.

En el jardín conviven también árboles exóticos, plantados antes de la formación del jardín, como el cedro del Atlas y la acacia de Japón (Sophora Japonica), en el Jardin y en toda la ciudad. De Australia proceden los eucaliptos, de Norteamérica el Arce Negundo y de otras zonas mediterráneas el Cercis Siliquastrum (árbol del amor).

La creación de este Jardín Educativo, inaugurado en 2008, se debe al mecenazgo de la familia Díaz-Bastien y Sánchez-Amellategui y la Fundación Solventia.